Если первый кратный 3, то после срабатывания условия if a[i] mod 3=0 и удаления элемента, должен быть выход из цикла(break).
Если ответ по предмету Информатика отсутствует или он оказался неправильным, то попробуй воспользоваться поиском других ответов во всей базе сайта.